Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms