Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms