Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CHMP4BP1P59074 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CHMP4BP1P59074 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CHMP4BP1P59074 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CHMP4BP1P59074 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CHMP4BP1P59074 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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CHMP4BP1P59074 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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CHMP4BP1P59074 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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CHMP4BP1P59074 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CHMP4BP1P59074 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CHMP4BP1P59074 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CHMP4BP1P59074 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CHMP4BP1P59074 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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