Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms