Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX16P57768 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX16P57768 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX16P57768 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX16P57768 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX16P57768 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX16P57768 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX16P57768 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX16P57768 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX16P57768 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX16P57768 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX16P57768 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX16P57768 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX16P57768 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX16P57768 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX16P57768 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX16P57768 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX16P57768 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX16P57768 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX16P57768 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX16P57768 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX16P57768 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX16P57768 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX16P57768 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX16P57768 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms