Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RIPK4P57078 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms