Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms