Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BACE1P56817 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BACE1P56817 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BACE1P56817 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms