Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAX9P55771 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAX9P55771 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PAX9P55771 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms