Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRAP54198 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRAP54198 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRAP54198 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRAP54198 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRAP54198 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRAP54198 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRAP54198 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRAP54198 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRAP54198 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRAP54198 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRAP54198 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRAP54198 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRAP54198 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRAP54198 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIRAP54198 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIRAP54198 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIRAP54198 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms