Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDST1P52848 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDST1P52848 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDST1P52848 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDST1P52848 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDST1P52848 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NDST1P52848 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDST1P52848 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms