Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms