Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCR4P51679 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCR4P51679 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCR4P51679 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCR4P51679 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCR4P51679 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms