Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms