Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP153P49790 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP153P49790 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP153P49790 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP153P49790 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP153P49790 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP153P49790 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP153P49790 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP153P49790 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP153P49790 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP153P49790 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP153P49790 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP153P49790 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP153P49790 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP153P49790 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP153P49790 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP153P49790 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP153P49790 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP153P49790 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP153P49790 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP153P49790 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP153P49790 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP153P49790 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP153P49790 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP153P49790 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP153P49790 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP153P49790 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP153P49790 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP153P49790 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP153P49790 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP153P49790 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP153P49790 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP153P49790 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP153P49790 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP153P49790 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP153P49790 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP153P49790 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP153P49790 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP153P49790 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP153P49790 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP153P49790 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP153P49790 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP153P49790 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP153P49790 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP153P49790 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP153P49790 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP153P49790 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP153P49790 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP153P49790 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP153P49790 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP153P49790 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP153P49790 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP153P49790 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP153P49790 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP153P49790 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP153P49790 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP153P49790 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP153P49790 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP153P49790 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP153P49790 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP153P49790 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP153P49790 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP153P49790 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP153P49790 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP153P49790 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP153P49790 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP153P49790 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP153P49790 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP153P49790 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP153P49790 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP153P49790 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP153P49790 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP153P49790 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP153P49790 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP153P49790 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP153P49790 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP153P49790 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP153P49790 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP153P49790 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP153P49790 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP153P49790 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP153P49790 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP153P49790 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP153P49790 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms