Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLK1P49759 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLK1P49759 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms