Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPFP49454 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPFP49454 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPFP49454 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPFP49454 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPFP49454 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPFP49454 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPFP49454 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPFP49454 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPFP49454 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPFP49454 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPFP49454 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPFP49454 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPFP49454 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPFP49454 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPFP49454 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPFP49454 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPFP49454 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPFP49454 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPFP49454 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPFP49454 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPFP49454 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPFP49454 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPFP49454 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPFP49454 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPFP49454 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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