Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms