Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDO2P48775 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDO2P48775 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDO2P48775 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDO2P48775 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDO2P48775 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDO2P48775 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDO2P48775 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDO2P48775 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms