Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms