Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms