Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPZBP47756 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms