Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC1A1P43005 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms