Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms