Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL9P32969 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL9P32969 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL9P32969 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPL9P32969 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPL9P32969 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms