Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 LYRM4-207ENST00000480566 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC018541.1-201ENST00000517706 764 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 CD226-202ENST00000577287 1009 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AP000866.2-201ENST00000504932 1493 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 Z98949.1-208ENST00000597614 816 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AL049651.1-201ENST00000440798 719 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 C2-AS1-201ENST00000630806 762 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 IL36G-201ENST00000259205 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms