Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms