Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms