Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLNP26678 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLNP26678 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PLNP26678 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms