Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms