Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
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