Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms