Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLP19338 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLP19338 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCLP19338 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCLP19338 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCLP19338 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCLP19338 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCLP19338 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCLP19338 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCLP19338 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCLP19338 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLP19338 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLP19338 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms