Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XBP1P17861 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XBP1P17861 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XBP1P17861 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XBP1P17861 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XBP1P17861 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XBP1P17861 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XBP1P17861 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XBP1P17861 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
XBP1P17861 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
XBP1P17861 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XBP1P17861 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XBP1P17861 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XBP1P17861 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XBP1P17861 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XBP1P17861 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XBP1P17861 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XBP1P17861 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XBP1P17861 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XBP1P17861 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XBP1P17861 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XBP1P17861 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XBP1P17861 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XBP1P17861 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XBP1P17861 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XBP1P17861 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XBP1P17861 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XBP1P17861 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms