Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJA1P17302 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJA1P17302 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJA1P17302 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJA1P17302 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA1P17302 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA1P17302 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA1P17302 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA1P17302 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA1P17302 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA1P17302 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA1P17302 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA1P17302 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA1P17302 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA1P17302 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA1P17302 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA1P17302 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms