Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3L1P16619 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms