Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms