Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD44P16070 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD44P16070 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD44P16070 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD44P16070 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD44P16070 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD44P16070 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD44P16070 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD44P16070 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD44P16070 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD44P16070 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD44P16070 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD44P16070 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CD44P16070 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD44P16070 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD44P16070 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD44P16070 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD44P16070 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD44P16070 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CD44P16070 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD44P16070 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD44P16070 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms