Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC1P15941 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC1P15941 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MUC1P15941 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MUC1P15941 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MUC1P15941 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MUC1P15941 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MUC1P15941 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MUC1P15941 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MUC1P15941 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MUC1P15941 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms