Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG2P13521 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG2P13521 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG2P13521 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG2P13521 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG2P13521 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG2P13521 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG2P13521 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG2P13521 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG2P13521 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG2P13521 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG2P13521 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG2P13521 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG2P13521 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG2P13521 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG2P13521 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms