Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms