Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms