Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms