Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPBP07199 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPBP07199 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPBP07199 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPBP07199 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPBP07199 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPBP07199 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPBP07199 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPBP07199 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPBP07199 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPBP07199 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPBP07199 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPBP07199 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPBP07199 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPBP07199 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPBP07199 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPBP07199 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPBP07199 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPBP07199 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPBP07199 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPBP07199 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPBP07199 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPBP07199 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPBP07199 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPBP07199 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPBP07199 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPBP07199 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPBP07199 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPBP07199 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPBP07199 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPBP07199 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPBP07199 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPBP07199 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPBP07199 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPBP07199 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPBP07199 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms