Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B1P05026 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B1P05026 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B1P05026 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B1P05026 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B1P05026 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B1P05026 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B1P05026 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B1P05026 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B1P05026 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B1P05026 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms