Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA2P02652 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA2P02652 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA2P02652 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA2P02652 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA2P02652 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA2P02652 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA2P02652 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA2P02652 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA2P02652 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA2P02652 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA2P02652 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA2P02652 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA2P02652 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA2P02652 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA2P02652 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA2P02652 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA2P02652 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA2P02652 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA2P02652 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA2P02652 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA2P02652 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA2P02652 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA2P02652 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA2P02652 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA2P02652 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA2P02652 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA2P02652 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA2P02652 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA2P02652 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms