Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFRP00533 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFRP00533 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFRP00533 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFRP00533 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFRP00533 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFRP00533 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFRP00533 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFRP00533 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFRP00533 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFRP00533 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFRP00533 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFRP00533 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFRP00533 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EGFRP00533 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EGFRP00533 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EGFRP00533 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EGFRP00533 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EGFRP00533 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EGFRP00533 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EGFRP00533 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EGFRP00533 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EGFRP00533 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EGFRP00533 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EGFRP00533 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EGFRP00533 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EGFRP00533 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EGFRP00533 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EGFRP00533 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EGFRP00533 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EGFRP00533 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EGFRP00533 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGFRP00533 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGFRP00533 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGFRP00533 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGFRP00533 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGFRP00533 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGFRP00533 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGFRP00533 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGFRP00533 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGFRP00533 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGFRP00533 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGFRP00533 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGFRP00533 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms