Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms