Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms