Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD4O95243 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD4O95243 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD4O95243 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD4O95243 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD4O95243 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD4O95243 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD4O95243 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD4O95243 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD4O95243 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD4O95243 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD4O95243 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD4O95243 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD4O95243 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD4O95243 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD4O95243 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD4O95243 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD4O95243 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD4O95243 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD4O95243 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD4O95243 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD4O95243 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD4O95243 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD4O95243 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD4O95243 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD4O95243 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD4O95243 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD4O95243 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD4O95243 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD4O95243 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD4O95243 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD4O95243 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD4O95243 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MBD4O95243 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD4O95243 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms